MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum NCC2705 chromosome

Total Repeats: 6651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004307	ACGC	2	8	294	301	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004307	CGC	2	6	367	372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_004307	CGG	2	6	389	394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004307	GTC	2	6	460	465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004307	GGA	2	6	510	515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004307	T	6	6	2206	2211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004307	GTAT	2	8	2566	2573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004307	GGC	2	6	2574	2579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004307	GGA	2	6	2606	2611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004307	TCCA	2	8	4149	4156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004307	GGC	2	6	4198	4203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004307	CCG	2	6	4207	4212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_004307	AGC	2	6	4213	4218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004307	CGC	2	6	4227	4232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_004307	CGC	2	6	4269	4274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_004307	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004307	AAGG	2	8	6221	6228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004307	TCC	2	6	7873	7878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_004307	GCGT	2	8	7898	7905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_004307	CCT	2	6	8904	8909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_004307	TCT	2	6	8951	8956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004307	AGGA	2	8	9034	9041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004307	TAGC	2	8	11672	11679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_004307	CTGA	2	8	11724	11731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_004307	CA	3	6	11746	11751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004307	GT	3	6	13173	13178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004307	CGA	2	6	14852	14857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004307	CTG	2	6	14915	14920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004307	ATCCA	2	10	16418	16427	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_004307	CCA	3	9	16425	16433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_004307	TCCCA	2	10	17284	17293	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_004307	CGC	2	6	17297	17302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_004307	CGA	2	6	17348	17353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004307	GAC	2	6	19289	19294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004307	TCAG	2	8	19329	19336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_004307	TGC	2	6	19340	19345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004307	CT	3	6	19354	19359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_004307	TAT	2	6	20926	20931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004307	CG	3	6	22348	22353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_004307	GAG	2	6	22361	22366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004307	CTTCGG	2	12	24228	24239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004307	CGG	2	6	24241	24246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004307	GAG	2	6	24272	24277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004307	AAT	2	6	24315	24320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004307	AAC	2	6	24499	24504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_004307	TTC	2	6	24570	24575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004307	GAG	2	6	24607	24612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004307	GT	3	6	26123	26128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004307	TCC	2	6	26131	26136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_004307	CGC	2	6	29652	29657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_004307	GAA	2	6	29669	29674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004307	GGA	2	6	29717	29722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004307	GCT	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_004307	AGC	2	6	31314	31319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004307	AGC	2	6	31357	31362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004307	GAACA	2	10	31374	31383	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_004307	ATC	2	6	31404	31409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004307	AAG	2	6	31548	31553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004307	TCA	2	6	31597	31602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_004307	CGG	2	6	31607	31612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004307	TGG	2	6	31618	31623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004307	TGA	2	6	31742	31747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004307	CGA	2	6	31805	31810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004307	GAATGT	2	12	32140	32151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004307	GAC	3	9	32208	32216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004307	AAC	2	6	32277	32282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004307	TCC	2	6	33277	33282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_004307	CCGC	2	8	33325	33332	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_004307	GGC	2	6	33361	33366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004307	CT	3	6	35991	35996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_004307	CAA	2	6	37459	37464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004307	ATA	2	6	41660	41665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004307	TTG	2	6	41673	41678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004307	TAT	2	6	41740	41745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004307	TTA	2	6	41797	41802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004307	ATC	2	6	41913	41918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004307	A	6	6	41920	41925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004307	GAG	3	9	41938	41946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004307	CTG	2	6	42941	42946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004307	TGATG	2	10	42975	42984	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004307	TTCC	2	8	42999	43006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_004307	TG	3	6	43020	43025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004307	AC	4	8	46740	46747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_004307	GCT	2	6	46775	46780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004307	CAG	2	6	46796	46801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004307	CTTT	2	8	46821	46828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_004307	TTC	2	6	46835	46840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004307	TGCG	2	8	48455	48462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_004307	ACC	2	6	48512	48517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_004307	TTGGT	2	10	48572	48581	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004307	ATA	2	6	48653	48658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004307	CTGCC	2	10	48660	48669	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_004307	CTGC	2	8	48722	48729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_004307	CGG	2	6	48747	48752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004307	GGC	2	6	48764	48769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_004307	GCG	2	6	49688	49693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_004307	GGC	2	6	49694	49699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_004307	GTT	2	6	49741	49746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004307	AAC	2	6	50297	50302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004307	TTG	2	6	50337	50342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004307	TTA	2	6	50399	50404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004307	TGTT	2	8	50485	50492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004307	CAA	2	6	50506	50511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_004307	CGGC	2	8	50544	50551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_004307	GAT	2	6	50583	50588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004307	CTT	2	6	51297	51302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004307	CAT	2	6	51318	51323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_004307	GCC	2	6	52205	52210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_004307	TTC	2	6	55441	55446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004307	CAA	2	6	55665	55670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_004307	GTA	2	6	56695	56700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004307	G	7	7	56718	56724	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004307	CG	4	8	57532	57539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_004307	CCA	2	6	57553	57558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_004307	GCAT	2	8	57590	57597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_004307	CGA	2	6	57648	57653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004307	GT	3	6	57674	57679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004307	TGA	2	6	57733	57738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004307	AAGG	2	8	57750	57757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004307	GGC	2	6	58594	58599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004307	TGCAT	2	10	58604	58613	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_004307	GT	3	6	58660	58665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004307	CAC	2	6	58726	58731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_004307	CTG	2	6	63239	63244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_004307	GCCG	2	8	66843	66850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_004307	GAGCC	2	10	66855	66864	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_004307	TGA	2	6	69678	69683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004307	GA	3	6	69714	69719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004307	ACTCC	2	10	69748	69757	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_004307	GCC	2	6	69767	69772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_004307	AGG	2	6	69804	69809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004307	GGC	2	6	70961	70966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_004307	GCT	2	6	70988	70993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_004307	TGG	2	6	71029	71034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004307	AGT	2	6	72159	72164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004307	CAT	2	6	72203	72208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004307	TG	3	6	72247	72252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004307	ATT	2	6	72281	72286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004307	GC	3	6	72301	72306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_004307	TGGC	2	8	72412	72419	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_004307	GGT	2	6	72424	72429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004307	GGCGTC	2	12	72446	72457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_004307	ACG	2	6	72471	72476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_004307	GAT	2	6	72481	72486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004307	TCG	2	6	72496	72501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_004307	TGTCGA	2	12	72552	72563	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_004307	GTC	2	6	72648	72653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_004307	GCC	2	6	73478	73483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_004307	GGC	2	6	73513	73518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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270	NC_004307	CAGGAG	2	12	113562	113573	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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282	NC_004307	CGAGA	2	10	123066	123075	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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284	NC_004307	ATG	2	6	125549	125554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_004307	CG	3	6	125752	125757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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421	NC_004307	CG	3	6	160814	160819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
422	NC_004307	GGC	2	6	160834	160839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_004307	CGT	2	6	160860	160865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_004307	GGT	2	6	160901	160906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
426	NC_004307	CGT	2	6	160971	160976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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428	NC_004307	TGGCG	2	10	161006	161015	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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430	NC_004307	TCGAA	2	10	161092	161101	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
431	NC_004307	TGA	2	6	161143	161148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_004307	GTC	2	6	161152	161157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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442	NC_004307	GAT	2	6	161442	161447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_004307	GC	3	6	161484	161489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
444	NC_004307	GCCG	2	8	161526	161533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
445	NC_004307	GGGAG	2	10	161756	161765	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
446	NC_004307	GAT	2	6	161949	161954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
447	NC_004307	GGA	2	6	161993	161998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
448	NC_004307	G	6	6	162023	162028	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
449	NC_004307	TC	3	6	162079	162084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
450	NC_004307	CGG	2	6	162216	162221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_004307	TCG	3	9	162232	162240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_004307	CGT	2	6	162260	162265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_004307	AGG	2	6	162322	162327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
454	NC_004307	AGC	2	6	162338	162343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_004307	GCC	2	6	162677	162682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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459	NC_004307	GTA	2	6	162771	162776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_004307	GCCG	2	8	162806	162813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
461	NC_004307	GGT	2	6	162818	162823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_004307	GAT	2	6	162887	162892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_004307	GCC	2	6	162959	162964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
464	NC_004307	TGG	2	6	162983	162988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_004307	CGG	2	6	163267	163272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_004307	GTA	2	6	165587	165592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_004307	CGC	2	6	167524	167529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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487	NC_004307	CGC	2	6	170164	170169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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490	NC_004307	CGA	2	6	170842	170847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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